Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDXQ7Z353 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HDXQ7Z353 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HDXQ7Z353 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDXQ7Z353 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HDXQ7Z353 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HDXQ7Z353 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HDXQ7Z353 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms