Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnfsf18Q7TS55 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf18Q7TS55 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf18Q7TS55 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnfsf18Q7TS55 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnfsf18Q7TS55 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms