Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc93Q7TQK5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc93Q7TQK5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc93Q7TQK5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc93Q7TQK5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc93Q7TQK5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc93Q7TQK5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc93Q7TQK5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc93Q7TQK5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc93Q7TQK5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc93Q7TQK5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc93Q7TQK5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc93Q7TQK5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc93Q7TQK5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc93Q7TQK5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc93Q7TQK5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ccdc93Q7TQK5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ccdc93Q7TQK5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc93Q7TQK5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc93Q7TQK5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms