Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LnpkQ7TQ95 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LnpkQ7TQ95 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LnpkQ7TQ95 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LnpkQ7TQ95 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LnpkQ7TQ95 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LnpkQ7TQ95 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LnpkQ7TQ95 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms