Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfp397Q7TNK4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfp397Q7TNK4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zfp397Q7TNK4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfp397Q7TNK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfp397Q7TNK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfp397Q7TNK4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfp397Q7TNK4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfp397Q7TNK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms