Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmc8Q7TN58 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmc8Q7TN58 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmc8Q7TN58 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tmc8Q7TN58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmc8Q7TN58 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmc8Q7TN58 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmc8Q7TN58 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmc8Q7TN58 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmc8Q7TN58 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmc8Q7TN58 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms