Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CATSPER4Q7RTX7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CATSPER4Q7RTX7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CATSPER4Q7RTX7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CATSPER4Q7RTX7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CATSPER4Q7RTX7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CATSPER4Q7RTX7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CATSPER4Q7RTX7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CATSPER4Q7RTX7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CATSPER4Q7RTX7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CATSPER4Q7RTX7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CATSPER4Q7RTX7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms