Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHST9Q7L1S5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHST9Q7L1S5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHST9Q7L1S5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHST9Q7L1S5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST9Q7L1S5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHST9Q7L1S5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms