Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TwistnbQ78WZ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TwistnbQ78WZ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TwistnbQ78WZ7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TwistnbQ78WZ7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TwistnbQ78WZ7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TwistnbQ78WZ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TwistnbQ78WZ7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms