Protein–RNA interactions for Protein: Q76I79

Ssh1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh1Q76I79 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ssh1Q76I79 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ssh1Q76I79 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ssh1Q76I79 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ssh1Q76I79 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ssh1Q76I79 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ssh1Q76I79 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ssh1Q76I79 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh1Q76I79 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms