Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZD4Q76G19 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD4Q76G19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZD4Q76G19 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZD4Q76G19 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZD4Q76G19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZD4Q76G19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 278.1 ms