Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CYS1Q717R9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYS1Q717R9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CYS1Q717R9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYS1Q717R9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CYS1Q717R9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CYS1Q717R9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms