Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Spcs3Q6ZWQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Spcs3Q6ZWQ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Spcs3Q6ZWQ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spcs3Q6ZWQ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spcs3Q6ZWQ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spcs3Q6ZWQ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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