Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC149Q6ZUS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC149Q6ZUS6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC149Q6ZUS6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC149Q6ZUS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC149Q6ZUS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC149Q6ZUS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC149Q6ZUS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms