Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
C15orf39Q6ZRI6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C15orf39Q6ZRI6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C15orf39Q6ZRI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C15orf39Q6ZRI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C15orf39Q6ZRI6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C15orf39Q6ZRI6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms