Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ncapd3Q6ZQK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Ncapd3Q6ZQK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ncapd3Q6ZQK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ncapd3Q6ZQK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ncapd3Q6ZQK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ncapd3Q6ZQK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ncapd3Q6ZQK0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ncapd3Q6ZQK0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ncapd3Q6ZQK0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Ncapd3Q6ZQK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Ncapd3Q6ZQK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms