Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nemp1Q6ZQE4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nemp1Q6ZQE4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nemp1Q6ZQE4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nemp1Q6ZQE4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nemp1Q6ZQE4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nemp1Q6ZQE4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nemp1Q6ZQE4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nemp1Q6ZQE4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nemp1Q6ZQE4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nemp1Q6ZQE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nemp1Q6ZQE4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms