Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPJ3

Ube2o, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBE2O, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2oQ6ZPJ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ube2oQ6ZPJ3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ube2oQ6ZPJ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ube2oQ6ZPJ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ube2oQ6ZPJ3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ube2oQ6ZPJ3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ube2oQ6ZPJ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ube2oQ6ZPJ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ube2oQ6ZPJ3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ube2oQ6ZPJ3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms