Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GBP6Q6ZN66 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GBP6Q6ZN66 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GBP6Q6ZN66 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GBP6Q6ZN66 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GBP6Q6ZN66 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GBP6Q6ZN66 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GBP6Q6ZN66 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms