Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CYHR1Q6ZMK1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CYHR1Q6ZMK1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CYHR1Q6ZMK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CYHR1Q6ZMK1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CYHR1Q6ZMK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYHR1Q6ZMK1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms