Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEACAM20Q6UY09 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CEACAM20Q6UY09 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CEACAM20Q6UY09 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEACAM20Q6UY09 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CEACAM20Q6UY09 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CEACAM20Q6UY09 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms