Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tcaf3Q6QR59 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tcaf3Q6QR59 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tcaf3Q6QR59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tcaf3Q6QR59 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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Tcaf3Q6QR59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tcaf3Q6QR59 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
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Tcaf3Q6QR59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tcaf3Q6QR59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tcaf3Q6QR59 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tcaf3Q6QR59 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
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