Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJG9

LRFN4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN4Q6PJG9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRFN4Q6PJG9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRFN4Q6PJG9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRFN4Q6PJG9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRFN4Q6PJG9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRFN4Q6PJG9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms