Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ULK3Q6PHR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ULK3Q6PHR2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK3Q6PHR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ULK3Q6PHR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ULK3Q6PHR2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ULK3Q6PHR2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms