Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE4

Znf316, Zinc finger protein 316, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf316Q6PGE4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Znf316Q6PGE4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Znf316Q6PGE4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Znf316Q6PGE4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Znf316Q6PGE4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Znf316Q6PGE4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Znf316Q6PGE4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Znf316Q6PGE4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Znf316Q6PGE4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Znf316Q6PGE4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Znf316Q6PGE4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Znf316Q6PGE4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Znf316Q6PGE4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Znf316Q6PGE4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf316Q6PGE4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Znf316Q6PGE4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf316Q6PGE4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Znf316Q6PGE4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Znf316Q6PGE4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Znf316Q6PGE4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms