Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rrm2bQ6PEE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rrm2bQ6PEE3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rrm2bQ6PEE3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrm2bQ6PEE3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrm2bQ6PEE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrm2bQ6PEE3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms