Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EMBQ6PCB8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EMBQ6PCB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EMBQ6PCB8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EMBQ6PCB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
EMBQ6PCB8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EMBQ6PCB8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMBQ6PCB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMBQ6PCB8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMBQ6PCB8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EMBQ6PCB8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms