Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd3Q6P9Z1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd3Q6P9Z1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd3Q6P9Z1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smarcd3Q6P9Z1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarcd3Q6P9Z1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smarcd3Q6P9Z1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd3Q6P9Z1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smarcd3Q6P9Z1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcd3Q6P9Z1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smarcd3Q6P9Z1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms