Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AtminQ6P9S1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AtminQ6P9S1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
AtminQ6P9S1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
AtminQ6P9S1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AtminQ6P9S1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AtminQ6P9S1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtminQ6P9S1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AtminQ6P9S1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AtminQ6P9S1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AtminQ6P9S1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms