Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx19Q6P4T1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Snx19Q6P4T1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx19Q6P4T1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Snx19Q6P4T1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Snx19Q6P4T1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Snx19Q6P4T1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Snx19Q6P4T1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx19Q6P4T1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx19Q6P4T1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx19Q6P4T1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Snx19Q6P4T1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx19Q6P4T1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms