Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CAVIN1Q6NZI2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CAVIN1Q6NZI2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CAVIN1Q6NZI2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CAVIN1Q6NZI2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CAVIN1Q6NZI2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CAVIN1Q6NZI2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CAVIN1Q6NZI2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms