Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3F3CQ6NXT2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3F3CQ6NXT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3F3CQ6NXT2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3F3CQ6NXT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3F3CQ6NXT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3F3CQ6NXT2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms