Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Wdr44Q6NVE8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Wdr44Q6NVE8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Wdr44Q6NVE8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Wdr44Q6NVE8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Wdr44Q6NVE8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Wdr44Q6NVE8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Wdr44Q6NVE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms