Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRNP1Q6NT89 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRNP1Q6NT89 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRNP1Q6NT89 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRNP1Q6NT89 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRNP1Q6NT89 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRNP1Q6NT89 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRNP1Q6NT89 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRNP1Q6NT89 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRNP1Q6NT89 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRNP1Q6NT89 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRNP1Q6NT89 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms