Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN12Q6JVE5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LCN12Q6JVE5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCN12Q6JVE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LCN12Q6JVE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms