Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SDE2Q6IQ49 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SDE2Q6IQ49 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDE2Q6IQ49 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDE2Q6IQ49 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDE2Q6IQ49 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDE2Q6IQ49 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SDE2Q6IQ49 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms