Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Edrf1Q6GQV7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Edrf1Q6GQV7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
Edrf1Q6GQV7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Edrf1Q6GQV7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Edrf1Q6GQV7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Edrf1Q6GQV7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Edrf1Q6GQV7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Edrf1Q6GQV7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Edrf1Q6GQV7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Edrf1Q6GQV7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Edrf1Q6GQV7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Edrf1Q6GQV7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Edrf1Q6GQV7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Edrf1Q6GQV7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Edrf1Q6GQV7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Edrf1Q6GQV7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Edrf1Q6GQV7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Edrf1Q6GQV7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms