Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP4Q6FHJ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SFRP4Q6FHJ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFRP4Q6FHJ7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFRP4Q6FHJ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFRP4Q6FHJ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms