Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC19Q6DKK2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC19Q6DKK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTC19Q6DKK2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTC19Q6DKK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTC19Q6DKK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTC19Q6DKK2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TTC19Q6DKK2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms