Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD96

Pcdhga7, Protocadherin gamma subfamily A, 7, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga7Q6DD96 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdhga7Q6DD96 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdhga7Q6DD96 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdhga7Q6DD96 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdhga7Q6DD96 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdhga7Q6DD96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdhga7Q6DD96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdhga7Q6DD96 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdhga7Q6DD96 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms