Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sptbn2Q68FG2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sptbn2Q68FG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sptbn2Q68FG2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sptbn2Q68FG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn2Q68FG2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sptbn2Q68FG2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sptbn2Q68FG2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms