Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ATG16L1Q676U5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATG16L1Q676U5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATG16L1Q676U5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATG16L1Q676U5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATG16L1Q676U5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATG16L1Q676U5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATG16L1Q676U5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms