Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATG9BQ674R7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG9BQ674R7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG9BQ674R7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG9BQ674R7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATG9BQ674R7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATG9BQ674R7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms