Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Capn3Q64691 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Capn3Q64691 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Capn3Q64691 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Capn3Q64691 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Capn3Q64691 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn3Q64691 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn3Q64691 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms