Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptpn13Q64512 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptpn13Q64512 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptpn13Q64512 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptpn13Q64512 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptpn13Q64512 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptpn13Q64512 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptpn13Q64512 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptpn13Q64512 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms