Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Gja3Q64448 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Gja3Q64448 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Gja3Q64448 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja3Q64448 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gja3Q64448 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gja3Q64448 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Gja3Q64448 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Gja3Q64448 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms