Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup62Q63850 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nup62Q63850 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nup62Q63850 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nup62Q63850 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nup62Q63850 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms