Protein–RNA interactions for Protein: Q62392

Phlda1, Pleckstrin homology-like domain family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phlda1Q62392 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Phlda1Q62392 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Phlda1Q62392 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Phlda1Q62392 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Phlda1Q62392 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Phlda1Q62392 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Phlda1Q62392 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Phlda1Q62392 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Phlda1Q62392 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phlda1Q62392 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phlda1Q62392 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phlda1Q62392 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phlda1Q62392 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Phlda1Q62392 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms