Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpcQ62241 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpcQ62241 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SnrpcQ62241 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SnrpcQ62241 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms