Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkd1Q62101 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkd1Q62101 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prkd1Q62101 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkd1Q62101 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkd1Q62101 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkd1Q62101 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkd1Q62101 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms